京都産業大学生命科学部では、ご活躍されている研究者をお招きし、生物学・生命科学に関する講演会「京都産業大学生命科学部バイオフォーラム」を不定期で開催しています。最先端の研究領域に触れる機会を提供することにより、学生・大学院生・教員の学習・研究意欲の向上及び学部・大学院の活性化を図ることを目的としています。

今回は、Patricia L. Clark博士　（Notre Dame大学）をお招きし、「Synonymous codon substitutions modulate transcription and translation of a divergent upstream gene」をテーマに講演していただきます。

一般の方にも生命科学の最先端の研究に触れるいただける機会となります。ぜひ、ご参加ください！

日時	2024年11月7日（木）
場所	京都産業大学 15号館1階15102セミナー室 キャンパスマップ
交通	※キャンパス内に駐車場はありません。公共交通機関をご利用ください。 交通アクセス
備考	事前申込不要・入場無料
主催	京都産業大学 生命科学部

Patricia L. Clark博士（Notre Dame大学）

「Synonymous codon substitutions modulate transcription and translation of a divergent upstream gene」

Synonymous codons were originally viewed as interchangeable, with no phenotypic consequences. However, substantial evidence has now demonstrated that synonymous substitutions can perturb a variety of gene expression mechanisms. To date, most studies of synonymous codon-derived perturbations have focused on effects within a single gene. Here we show that synonymous codon substitutions made far within an E. coli plasmid-encoded gene can significantly increase expression of a divergent upstream gene, due to antisense transcription originating from an intragenic transcription start site (TSS). Surprisingly, this transcription readily bypasses native transcriptional repression. Even more surprisingly, accumulation of the protein encoded by the upstream gene correlated with the fraction of RNA originating from the intragenic TSS, rather than total RNA. These effects of synonymous codon substitutions on intergenic transcription and translation suggest that synonymous codons in bacteria may be under selection to both preserve the amino acid sequence of the encoded gene and avoid internal sequence elements with the potential to significantly perturb expression of neighboring genes. Avoiding such sequences may be especially important in prokaryotic genomes, where genes and regulatory elements are densely packed.

※本講演は英語講演となります。通訳はありませんので，ご注意ください。